Edellämainittua asetusta täydennetään asetuksella Komission delegoitu asetus (EU) 2015/531. Asetuksessa yksilöidään kustannukset, joille voidaan myöntää EMKR:sta tukea mm. kalastajien hygienia-, terveys-, turvallisuus- ja työolojen parantamiseksi.
Kukin maa on laatinut toimintasuunnitelman sille EMKR:ssa varatun rahoitusosuuden käytöstä => Euroopan komission hyväksymä Suomen toimintaohjelma 2014-2020. Suomen toimintaohjelmassa kansalliset viranomaiset ovat päättäneet, mille hankkeille rahoitusta voidaan myöntää.